《解深密经》的核心思想在论证一切外境外法与识的关系，认为一切诸法乃识之变现，阿赖耶识是生死轮回的主体，是万物生起的种子。经中还提出了著名的“三性”、“三无性”问题，并深入地论述了一切虚妄分别相与真如实性的关系。

卷一

　序品第一

　胜义谛相品第二

　心意识相品第三

卷二

　一切法相品第四

　无自性相品第五

卷三

　分别瑜伽品第六

卷四

　地波罗蜜多品第七

卷五

　如来成所作事品第八

附录