飞天英雄米斯洛牺牲了，他的儿子米多与众多来自世界各地的少年成为联合国不错舰队未来战士训练营的一员。在一次训练中，未来战士们遭敌人“斯特拉”武装的暗算，被囚在海下基地。关键时刻，米多展现出超凡的军事才能，带领队友们从绝境中逃了出来。
在一次训练中，飞龙号战舰遭到突然袭击，艾琳娜离奇失踪了。米多和战友们偷偷前往邪恶军事基地营救艾琳娜。米多再次见到艾琳娜的时候，她已经被“斯特拉”雇佣的科学家进行了生化改造，变成一名邪恶的生化战士，将枪口对准了战友们！
在神秘的黑海湾，大量的海底石油被发现，邪恶武装“斯特拉”与世界上规模优选的海盗组织结成联盟，率先占领了黑海湾，肆无忌惮地开采石油，并对海洋造成了严重的污染。联合舰队奉命阻止斯特拉武装和海盗组织的违法行为，但出师不利，飞龙小队成为了俘虏。
“斯特拉”邪恶军团以出卖地球军事情报和能源为筹码，获得了外星军团的帮助。外星军团驾驶蝎子飞行器对地球发起攻击。猛烈的攻击让联合舰队措手不及，不错战舰几乎毁于一旦，受损的不错战舰不得不躲到原始森林深处的山体工事内进行抢修。敌我实力悬殊，一场保护地球的战役打响了！