Blue Ocean公司著的《暗岛三部曲(Ⅰ暗岛之谜)/乐高幻影忍者》讲述了一场吴大师和幻影忍者们鲜为人知的战斗经历。那个时候妮雅还不是忍者，寇还是个幽灵，他们打败了纳达可汗和飞天海盗，回到了忍者之城。就在这时，奇怪的事情发生了——渔民离奇消失，风暴席卷小岛。就连出海查看情况的美莎子和罗南也神秘失踪，他们还给吴大师留下一张字条——远离暗岛。
但是，面对邪恶威胁，吴大师和幻影忍者们岂能坐视不理？他们毅然决然踏上了去往暗岛的旅程。在那里等待他们的是新敌人还是老对手？他们的元素之力和幻影旋转术能否再次阻止世界末日的降临？