《朱丹溪医学全书(精)》中朱丹溪融汇刘、李、张三家之学说，去其短而用其长，创立了“相火论”等学说。“相火”存在于命门、肝、胆等脏腑中，与君火（心火）相互配合，起温养脏腑等重要作用。他还提出“阳常有余，阴常不足”的学术思想，在临证上提倡滋阴降火之法，故后世称之为滋阴派。

本草衍义补遗

 凡一百五十三种

 石钟乳

 硝

 白滑石

 铅丹

 浆水

 自然铜

 二术

 荪

 山药

 菊花

 甘草

 人参

 薏苡仁

 菟丝子

 肉苁蓉

 防风、黄芪

 蓝

 决明子

 芎

 五味子

 栝蒌实

 苦参

 郁金

 肉豆蔻

 大黄

 葶苈

 附子

 半夏

 常山

 羊蹄草

 芋

 牵牛

 萆麻

 荔枝肉

 灯心

 威灵仙

 五倍子

 金樱子

 萱草

 茯芩

 琥珀

 松

 柏

 桂

 枫香

局方发挥

格致余论

金匮钩玄

丹溪心法

丹溪手镜

丹溪治法心要

脉因证治