《黑贝街奇遇（下）》讲述四个小学生和黑眼圈小狗回到黑贝街12号，找到另一本日记，发现了老宅的真相：画家秋鹤原打算将黑贝街12号改建成孤儿院，走私集团却强占了老宅，并在此从事违法交易。最终，犯罪嫌疑人被逮捕，一支新的冒险队成立。